Мультисудоку
Программа может решать разновидности судоку, состоящие из нескольких квадратов 9 x 9. Такие головоломки называют Gattai (в переводе с японского: соединенный, связанный); в России также используется название мультисудоку.
Судоку-самурай ("Samurai Sudoku", "Gattai-5") – разновидность головоломки судоку. Игровое поле состоит из пяти квадратов размером 9 x 9. Цифры от 1 до 9 должны быть расставлены правильно во всех пяти квадратах.

Jigsaw Samurai Sudoku (судоку-самурай с регионами произвольной формы):

Судоку-цветок ("Flower Sudoku", "Musketry Sudoku") похожа на судоку-самурай. Игровое поле состоит из пяти квадратов размером 9 x 9; центральный квадрат целиком покрыт четырьмя другими. Цифры от 1 до 9 должны быть расставлены правильно во всех пяти квадратах.

Судоку-сохей ("Sohei Sudoku") названа в честь монахов-воинов в средневековой Японии. Игровое поле состоит из четырех квадратов размером 9 x 9. Цифры от 1 до 9 должны быть расставлены правильно во всех четырех квадратах.

Судоку-мельница ("Kazaguruma", "Windmill Sudoku") состоит из пяти квадратов размером 9 x 9: один в центре, четыре остальных квадрата почти полностью накрывают центральный квадрат. Цифры от 1 до 9 должны быть расставлены правильно во всех пяти квадратах.

Судоку-бабочка ("Butterfly Sudoku") состоит из четырех пересекающихся квадратов размером 9 x 9, которые образуют единый квадрат размером 12 x 12. Цифры от 1 до 9 должны быть расставлены правильно во всех четырех квадратах.

Судоку-крест ("Cross Sudoku") состоит из пяти квадратов. Цифры от 1 до 9 должны быть расставлены правильно во всех пяти квадратах.

Судоку-три ("Gattai-3") состоит из трех квадратов размером 9 x 9.

Двойные судоку ("Twodoku", "Sensei Sudoku", "DoubleDoku") состоят из двух квадратов размером 9 x 9. Цифры от 1 до 9 должны быть расставлены правильно в обоих квадратах.

Способы пересечения квадратов в двойных судоку могут быть различными. Головоломка может содержать и другие дополнительные условия; например, диагонали обоих квадратов также должны содержать цифры от 1 до 9:

Программа умеет решать двойные судоку, в которых регионы имеют произвольную форму:

Еще одна разновидность мультисудоку – тройные судоку ("Triple Doku"); головоломка состоит из трех квадратов размером 9 x 9. Цифры от 1 до 9 должны быть расставлены правильно во всех квадратах.

Форматы файлов:
- SSD – судоку-самурай;
- FSD – судоку-цветок;
- SOH – судоку-сохей;
- SKZ – судоку-мельница;
- BSD – судоку-бабочка;
- CRS – судоку-крест;
- GAT3 – судоку-три;
- TD1 – двойные судоку, два квадрата 9 x 9 (один общий регион);
- TD2 – двойные судоку, два квадрата 9 x 9 (два общих региона);
- TD4 – двойные судоку, два квадрата 9 x 9 (четыре общих региона);
- TRD2 – тройные судоку, три квадрата 9 x 9 (два общих региона);
- TRD4 – тройные судоку, три квадрата 9 x 9 (четыре общих региона).